Fermentai bioanalitikoje

• Katalizuoja aminorūgščių (išskyrus arginino, lizino ir prolino) atskėlimą nuo peptido C galo.
• Chimotripsino veikimas
• Chimotripsino aktyvaus centro struktūra
• Struktūra
•
•
• Radikalas
•
•
• Santykinis aktyvumas
•
•
• Glycil-
•
•
• H-
•
•
• 1
•
•
• Leucil-
•
•
•
•
• 1,6·104
•
•
• Metionil-
•
•
• CH3-S-CH2-CH2-
•
•
• 2,4·104
•
•
• Fenilalanil-
•
•
•
•
• 4,3·106
•
•
• Heksahidroksife-nilalanil-
•
•
•
•
• 8,2·106
•
•
• Tirozil-
•
•
•
•
• 3,7·107
•
•
• Triptofenil-
•
•
•
•
• 4,3·107
•
•
•
• Fermentų klasifikacija
• Oksidoreduktazės 4. Liazės
• Transferazės 5. Izomerazės
• Hidrolazės 6. Ligazės
• 1-3 klasės:
• Tarptautinės biochemikų draugijos Rekomendacijos (1961 m.)
• 1. Oksidoreduktazės
• Etanolis + NAD+ Etanalis + NADH
•
•
• NAD+
• Fermentų nomenklatūra
• Klasė
• Poklasis
• Grupė
• Fermentas (eilės tvarka)
• 1. Oksidoreduktazės
• 1.1. Oksiduojama grupė CH-OH (elektronų donoras)
• 1.1.1. Elektronų akceptorius NAD+ arba NADP+
• 1.1.1.1. Alkoholio dehidrogenazė
• 1.1.1.2. Alkoholio dehidrogenazė (NADP+)
• 1.1.1.3. Homoserindehidrogenazė
•
• 1. Oksidoreduktazės
• 1.1. Oksiduojama grupė CH-OH (elektronų donoras)
• 1.1.1. Elektronų akceptorius NAD+ arba NADP+
• 1.1.2. Elektronų akceptorius citochromas
• 1.1.3. Elektronų akceptorius deguonis
• 1.1.99. Elektronų akceptorius kitas
• 1.2. Oksiduojama grupė aldehidas arba ketonas
• 1.2.1. Elektronų akceptorius NAD+ arba NADP+
• 1.2.2. Elektronų akceptorius citochromas
• 1.2.3. Elektronų akceptorius deguonis
• 1.2.4. Elektronų akceptorius disulfidai
• 1.2.5. Elektronų akceptorius Fe-S baltymų klasteriai
• 1.2.99. Elektronų akceptorius kitas
• 1.3. Oksiduojama grupė CH-CH
• 1.4. Oksiduojama grupė CH-NH2
• 1.5. Oksiduojama grupė CH-NH-
• 1.6. Oksiduojamas NADH arba NADPH
• 1.7. Oksiduojamos kitos azotą turinčios grupės
•
• Katalizuojamas virsmas: oksidacija klasė: 1
• Oksiduojama grupė: hemiacetalis poklasė: 1
• Elektronų akceptorius: deguonis grupė: 3
• Fermento eilės numeris: 4
• -D-gliukozė:deguonis 1-oksidoreduktazė [1.1.3.4],
• gliukozės oksidazė (GOD)
• katalizuoja -D-gliukozės oksidaciją deguonimi:
•
• 3. Hidrolazės
• Polipeptido grandinė
• 3. Hidrolazės
• 3.1. Esterių hidrolizė
• 3.1.1. Karboksirūgščių esterių hidrolizė
• 3.1.2. Tioesterių hidrolizė
• 3.1.3. Fosforo rūgšties monoesterių hidrolizė
• 1.1.4. Fosforo rūgšties diesterių hidrolizė
• 3.2. Glikozilinių darinių hidrolizė
• 3.2.1. O-glikozidų hidrolizė
• 3.2.2. N-glikozidų hidrolizė
• 3.2.3. S-glikozidų hidrolizė
• 3.3. Eterių hidrolizė
• 3.3.1. Tioeterių hidrolazės
• 3.3.2. Eterių hidrolazės
• 3.4. Peptidų hidrolizė (peptidazės)
•
• 2. Transferazės
• 2. Transferazės
• 2.1. Pernešama grupė turi vieną anglies atomą
• 2.1.1. Metiltransferazės
• 2.1.1.1. Nikotinamidmetiltransferazė
•
• 2. Transferazės
• 2.1. Pernešama grupė turi vieną anglies atomą
• 2.1.1. Metiltransferazės
• 2.1.2. Hidroksimetil-, formil- ir panašių grupių pern.
• 2.1.3. Karboksil- ir karbomoiltransferazės
• 2.1.4....

Daugiau informacijos...