Genomika: lyginamoji, funkcinė, struktūrinė. Transkriptomas. Proteomas ir proteomika; proteomo ir genomo santykis. Farmakogenomika

Genomika - genų ir jų funkcijų tyrimas. Genomika tiria genus ir ištisus genomus. Jau žinoma 599 virusų ir viroidų, 205 plazmidžių, 185 organelių, 31 eubakterijos, 7 archeabakterijų, 1 grybo, 2 gyvūnų ir 1 augalo genomai. Rezultatas - matome kaip genomai skiriasi pagal įvairias savybes: genus, judriuosius elementus, GC kiekį, CpG salas ir rekombinacijos lygį. Tai leidžia nustatyti genų funkcijas. Žmogaus genomo dydis - apie 3200 Mb, euchromatino dydis - 2900 Mb.
-tarp artimai giminingų rūšių - genų struktūros ir funkcijos unikalumą.
Priemonės: fizinio ir genetinio kartografavimo metodų vystymas, daugiau cDNR šaltinių gavimas, kitų genomų identifikavimas.
Pvz., konservatyvūs segmentai pelėje ir žmoguje. Bendras protėvis gyveno prieš 100 Myr (millions of years). Remiantis sintenija tarp genų, laikoma, kad genai sukibę tarpusavyje vienoje rūšyje, bus sinteniniai ir kitoje rūšyje. Sintenija priklauso nuo fizinio atstumo tarp lokusų ir tarp evoliucinio atstumo tarp rūšių. Genų sekos konservatyvumas leidžia: 1) identifikuoti ortologus tarp rūšių; 2) evoliucinį protėvį: 3) žmogaus genolapį bus galima panaudoti pelės sekvenavimui.
Funkcinė genomika. Lygina ir analizuoja sekas, kurios lemia tam tikrą funkciją. Tiria mRNR, baltymus. Naudojama cDNR, ne baltymus koduojančių sekų, lyginamoji genų ekspresijos analizė, genomo mutagenezė, globalinė baltymų analizė.
Struktūrinė genomika. Tiria erdvinę baltymo struktūrą. Iš gautų duomenų galima nustatyti: 1) evoliucinius ryšius, kurių negalima nustatyti pagal seką, ir funkcijas. Kiekvienai baltymų šeimai būdinga tam tikra struktūra. 2) paviršiaus savybes; 3) sąveikos su ligandu galimybė. Metodai: rentgeno kristalografija, NMR spektroskopija.
Transkriptomas. Genomo analizė duoda duomenis apie RNR kiekius. Visa ląstelės, organo, organizmo pagaminama RNR tam tikru metu - transkriptomas. RNR gali būti koduojanti arba nekoduojanti. Todėl galutinis geno produktas gali būti baltymas arba RNR. Taigi transkriptoma neatitinka proteomos. Nekoduojančios RNR rūšys: tRNR (žmogaus 1310 arba 497 genai), rRNR, snoRNR(mažos branduolėlio RNR) ir snRNR (mažos branduolio RNR - 97 genai).
Proteoma - baltymų visuma, kurie duotu laiku ekspresuojami organizme, organe ar ląstelių linijoje. Baltymai ekspresuojami tam tikru laiku ir...

Daugiau informacijos...

★ Klientai rekomenduoja

Šį rašto darbą rekomenduoja mūsų klientai. Ką tai reiškia?

Mūsų svetainėje pateikiama dešimtys tūkstančių skirtingų rašto darbų, kuriuos įkėlė daugybė moksleivių ir studentų su skirtingais gabumais. Būtent šis rašto darbas yra patikrintas specialistų ir rekomenduojamas kitų klientų, kurie po atsisiuntimo įvertino šį mokslo darbą teigiamai. Todėl galite būti tikri, kad šis pasirinkimas geriausias!